Исследователи обнаружили, что макрофаги сразу после заражения корректируют свои молекулярные сигнальные цепочки. Эта кратковременная память влияет на то, как макрофаги реагируют на последующие заражения и иммунные сигналы: иногда она делает клетки менее восприимчивыми, иногда усиливает их иммунный ответ.
В классических представлениях врождённый иммунный ответ отличается от адаптивного тем, что он не приспосабливается; у него нет памяти о предыдущих стимулах. Однако некоторые недавние исследования показали, что макрофаги могут по-разному реагировать на раздражители. Авторы работы протестировали влияние 80 различных условий — варьируемых доз шести различных бактериальных и вирусных молекул — на активность макрофагов с помощью разработанной ими ранее высокопроизводительной микрофлюидной платформы. Они показали, что воздействие воспалительных сигналов иногда приводит к «запуску» эффекта, делая макрофаги более восприимчивыми к будущим угрозам. Но в других случаях это приводит к толерантности, когда макрофаги слабее или медленнее реагируют на повторное воздействие. В целом более высокие дозы и более длительное воздействие патогена повышают толерантность, что может быть адаптацией, предотвращающей чрезмерную активацию иммунной системы. Более короткое воздействие или более низкие дозы часто приводят к праймированию, подготавливая макрофаги к более агрессивному реагированию на угрозы.
Когда команда исследователей выделила макрофаги из организма мыши с сепсисом, они обнаружили, что иммунный ответ этих клеток был слабее обычного. Это наблюдение помогает объяснить, почему пациенты с сепсисом могут быть уязвимы для вторичной инфекции. Оно также позволяет предположить, что повышение активности макрофагов — или блокирование этой «толерантности» — может помочь в лечении сепсиса.
Затем исследователи показали, что при воздействии на макрофаги воспалительных сигналов их активность меняется вместе с изменениями в том, как ключевой регулятор иммунитета, известный как ядерный фактор каппа-B (NF-κB), активируется и перемещается в ядро с течением времени. В то же время изменилась доступность определённых участков ДНК, что повлияло на то, насколько легко NF-κB и другие регуляторные белки могут связываться с генами воспаления и активировать их.
Объединив данные о сигнальных путях NF-κB и доступности хроматина, команда разработала модель машинного обучения, которая может предсказывать, как макрофаги будут реагировать на новые воспалительные сигналы на основе предшествующего воздействия.